2008 年，在研究所支持下，成立了国际合作非洲研究团队。研究团队在承担项目过程中开始逐步进行研究站实验室的建设推进。

2013年8月，中国科学院张亚平副院长为位于坦桑尼亚基戈马的坦噶尼喀湖水环境监测与生态保护示范实验室举行揭牌仪式。

2016年位于内罗毕的中国科学院中非联合研究中心海外科教基地“水资源与生态环境实验室”完成仪器安装和调试。

2016年4月25日，在白春礼院长和坦桑尼亚科学与技术委员会Hassan Mshinda主任的共同见证下，我所沈吉所长与坦桑尼亚渔业研究所Semvua I. Mzighani所长签署合作备忘录，双方同意进一步加强彼此在人员交流、科研协作等方面的合作，并就共建东非大湖与城市生态合作研究站达成共识。

2016年8月签署合作研究站建设备忘录，开始了位于坦桑尼亚渔业研究所达累斯萨拉姆总部的中心站实验室和办公室用房的改造建设。2017年5月，完成办公区和实验室基建。

2017年8月17日，中国驻坦桑尼亚经济商务代表处孙成峰先生与坦桑尼亚渔业研究所Rashid Adam Tamatamah博士出席在达累斯萨拉姆举行了东非大湖城市生态联合研究站（EAGLUE）的揭牌仪式。

2018年7月，研究站配置基本设施，开始办公室使用与实验场所初运行。

2019年6月，捐赠了一批价值约20万元人民币的水化学分析设备，研究站实验室设备配置基本到位，满足样品预处理及部分指标分析需求。

2020年起，承担科技部对发展中国家科技援助项目“坦桑尼亚大湖流域水环境保护能力提升与技术合作”，通过与坦桑尼亚渔业研究所合作，持续推进东非大湖与城市生态合作研究站建设。

2023年4月，在我国驻坦使馆和坦桑尼亚渔业部见证下，张甘霖所长和Ismael A. Kimirei所长共同签署仪器移交协议。中科院南京地湖所向坦桑尼亚渔业研究所移交了水环境、水生态监测相关仪器设备40台/套，试剂耗材等共计1086件，价值五十余万元。这些仪器和耗材将用于坦桑尼亚渔业研究所姆万扎、基戈马、姆贝亚野外站基础建设。