维多利亚湖基地主要设备包括：超纯水机、烘箱、分光光度计、万分之一天平、百分之一天平、4孔恒温水浴锅、磁力搅拌器、灭菌锅、深水采样器、温盐深仪 、原子吸收仪、BOD培养仪、恒温培养箱、多参数水质仪、大气沉降采集设备、小型气象站等。